據臺灣《中時電子報》10月19日報道，臺灣當局發言人黃重諺間表示，“總統府”秘書長林碧炤多次向蔡英文請辭，已批準并于10月20日生效;秘書長職務由副秘書長劉建忻暫時代理。蔡英文也同意“國安局”局長楊國強請辭，新任局長將由“前空軍司令”彭勝竹上將接任，預計這一兩周內完成交接工作后上任。

　　黃重諺表示，林碧昭秘書長4月接到蔡英文邀請擔任秘書長，深感責任重大，為了穩定島內政局、協助蔡英文，因此答應接下職務。黃重諺說，林秘書長認為目前已符合當初接此職務的初衷，既然階段性任務完成，希望盡早將職務讓出，以利蔡英文晉用下一階段所需人才。

　　黃重諺說，蔡英文對于林秘書長堅決辭意表示理解，也多次慰留，并尊重老友希望退休專心寫作的期望。