據臺灣媒體報道，臺灣當局領導人馬英九表示，臺灣能參與世界衛生大會是大陸釋出善意。過去一年來，兩岸關系大幅改善，雙方互信互諒也有增進，在許多議題上，大陸體現了胡錦濤總書記六點意見的精神。兩岸的和解雙贏，是中華民族對世界和平的重要貢獻。臺灣行政當局負責人劉兆玄也表示，大陸的善意是臺灣獲邀以觀察員身份參加世衛大會的一個重要因素。
臺北市衛生局局長邱文祥在接受記者采訪時表示，兩岸醫療衛生界的溝通交流其實一直沒有斷過。中華臺北衛生署獲邀以觀察員身份參加世界衛生大會，將進一步促進兩岸醫療衛生界的交流與合作，讓兩岸在共同防治疫病方面做得更好，從而更好地保障臺灣同胞的健康福祉。
臺灣知名律師許文彬說，這是兩岸關系“春暖花開”的又一具體表現，有利于兩岸進一步累積互信。
臺灣學者蘇嘉宏認為，這充分說明，在兩岸關系和平發展以及兩岸不斷累積互信的基礎上，臺灣與外界的互動空間才會越來越寬廣。
另據外電報道，各國輿論普遍對兩岸妥善解決臺灣以觀察員身份參加世衛大會問題表示歡迎，認為這是兩岸關系取得的重大積極進展，體現了大陸方面對臺灣的極大善意，將有助于兩岸進一步建立互信，有助于推動兩岸關系和平發展。
