臺灣《聯合報》3日發表署名文章指出，中共中央總書記胡錦濤日前提出對臺政策新六項原則，其中一項提及兩岸應推動簽署“綜合性經濟協作結構”，此一建議可說是正面回應了馬英九的想法。兩岸若能簽署經濟協作協議，不但對臺灣經濟會有重大效果，且因兩岸間存在許多敏感政治問題，若能簽署，自然也會有重要的政治意涵。

　　文章說，對于以貿易為導向的臺灣而言，如果兩岸進行自由貿易會大大增加臺灣對大陸的出口，尤其是受到當前國際金融風暴的影響，兩岸貿易自由化就顯得更為重要。此外，臺商海外投資中，超過七成是前往大陸投資，有了“綜合性經濟協議”之后，大陸臺商的投資將可獲得實質的保障。

　　在綜合性經濟協作協議下，臺灣的人流、物流、與金流都可以完全自由的在兩岸之間流動，臺灣不但有機會成為臺商營運中心，而且臺灣也有機會吸引更多的外資到臺灣來，或者可在臺灣生產，行銷大陸；或者利用臺灣的人力與技術，把臺灣當成進入大陸市場的平臺。

　　文章指出，2010年大陸與東協國的自由貿易區即將成立，其后，日本與韓國也將陸續與東協國成立自由貿易區，我們看到某種形式的東亞自由貿易區即將出現，臺灣卻不得其門而入。如果臺灣與大陸簽署綜合性經濟協作協議之后，臺灣也將有足夠的理由與新加坡、日本、美國等國家簽者自由貿易協議。

　　文章認為，除了上述重要的經濟意涵以外，兩岸簽署綜合性經濟協作協議也有重要的政治意涵在內。因為發展經濟關系是對雙方都有好處的，因此雙方可以借著經濟關系發展來創建起雙方的互信關系。如果能簽署綜合性經濟協作協議，可以讓雙方的互信基礎大大的往前邁進一大步。在這個互信基礎上，未來進行政治性協商時，應該就會容易很多。

　　文章說，以當前兩岸經貿發展的關系來看，要立即簽署全面的綜合性經濟協議不容易。且就算簽署后也很難立即實施，以大陸與東協所簽署的自由貿易協議為例，簽署時間為2002年，正式實施則為2010年。因此，我們認為兩岸可先簽署一個“框架集性協議”，其中只有些較簡單協議，然后在此框架集性協議下，兩岸再就經貿正常化（即WTO原則）、關稅減讓、再到經貿自由化等等事項逐漸協商，最后再走向全面性的綜合性經濟協作協議。（作者為臺灣政治大學經濟系教授）